基因球爆炸，超级文明的邪恶计划宣告失败。接班人带着小队离开神秘领域，他知道宇宙基因安全依然任重道远，但他已做好终身守护的准备。
接班人回到学院后，并未放松警惕。他深知宇宙中可能还潜藏着许多类似威胁基因安全的因素。于是他开始着手改进学院的基因教育体系，希望能培养出更多像他一样优秀的基因守护者。
他编写了一系列涵盖从基础基因知识到高级基因作战技巧以及宇宙基因伦理的教材。并且设立了专门的模拟实战课程，让学员们能更好地应对各种突发状况。
几年后，一批批优秀学员毕业走向宇宙各地。有一天，接班人收到消息，在银河系边缘发现了疑似外星文明入侵的迹象，那些外星生物的基因构造极为奇特。接班人毫不犹豫地率领自己精心训练的精英团队前往调查。到达后，他发现这些外星生物并非恶意入侵，而是因为他们的母星基因崩溃，前来寻求帮助。接班人运用自己丰富的基因知识，尝试修复这些外星生物的基因缺陷。经过艰苦努力，终于成功，不仅化解了一场潜在危机，还与这个外星文明达成友好协议，共同维护宇宙基因安全。从此，宇宙基因安全多了一份来自外星文明的助力。
在与外星文明合作维护宇宙基因安全一段时间后，接班人在一次对遥远星系的巡查中，发现了一种新型的基因侵蚀现象。这种侵蚀悄无声息，却能改变生物原本的基因特征，使其逐渐失去自我意识。
他带领团队深入研究，发现源头是一颗暗星散发的特殊辐射。这颗暗星周围存在着一种智能微生物，它们操纵着辐射影响周边基因。
接班人想到之前对付基因魔神时的经历，决定寻找克制这种微生物的物质。经过多方探寻，他们在一个废弃的古老空间站发现了一种稀有晶体。
他带领队员将晶体带回暗星附近，利用科技手段让晶体能量扩散。晶体能量与微生物的基因结构相克，很快就抑制住了微生物的活动。
随着微生物被压制，暗星辐射的基因侵蚀效果也渐渐消失。此次事件过后，接班人更加注重对宇宙各个角落的监控，防止类似未知威胁再次危害宇宙基因安全。
在接班人更加严密的监控下，宇宙基因安全维持了很长一段时间的稳定。然而，平静之下总有暗流涌动。一天，基因预警系统探测到一个神秘信号，这信号来自宇宙深处一个从未被探索过的黑洞附近。接班人率领团队前往探查。
到达目的地后，他们发现黑洞周围的时空呈现出奇异的扭曲状态，有一种无形的力量拉扯着他们的飞船。好不容易稳定住飞船，他们看到了一艘巨大的、散发着幽蓝光芒的古老飞船残骸。船身布满了奇怪的纹路，像是一种古老的基因图腾。
正当他们准备登船查看时，从残骸中涌出一群似虚非实的影子生物。这些生物的基因波动极其怪异，它们能穿透实体防御直接攻击基因层面。接班人急忙指挥大家集中基因能量构建精神护盾，抵御影子生物的攻击。