年轻学员回到学院后，受到了英雄般的欢迎。但他却高兴不起来，因为他意识到还有更多隐藏在暗处的危险等待着他们。于是，他向学院高层提议，成立一支专门应对此类危险基因事件的精英小队，由他亲自训练。学院高层欣然同意。
经过一段时间的筹备，精英小队正式成立。然而就在这时，宇宙间各个势力听闻学院拥有如此强大的基因技术，纷纷发来合作邀请，实则暗藏窥探之心。年轻学员深知其中利害，他挑选了几个较为友好且真诚的势力进行有限度的合作交流。
在一次交流会上，年轻学员展示了部分基因改良技术成果，引起了轩然大波。但同时也引来了一些不法分子的觊觎。他们暗中策划绑架年轻学员，以获取全部技术资料。不过，年轻学员早有防备，利用基因追踪技术反制了这些不法分子，将他们交给星际联盟处理。从此，学院在年轻学员的守护下稳步发展，而他也继续在探索宇宙基因奥秘的道路上坚定前行。
在之后的日子里，年轻学员一边训练精英小队，一边深入研究基因技术。一日，他在研究中偶然发现一种奇特的基因序列，这种序列不属于已知的任何物种或文明。正当他准备进一步探究时，学院的预警系统再次响起。这次的威胁来自一颗神秘的小行星，它正朝着学院所在星球飞来，而且上面散发着强烈的基因波动。
年轻学员带领精英小队出发迎击。靠近小行星后才发现，这颗小行星竟然是一个巨大的移动实验室，里面有着各种被改造得奇形怪状的生物兵器。这些生物兵器悍不畏死，冲向他们。年轻学员指挥小队成员巧妙应对，他本人则潜入实验室内部。
在内部，他发现幕后黑手居然是之前那些黑袍人的残党勾结其他星系的野心家所为。年轻学员果断使用新技术冻结了整个实验室的能源供应，使所有生物兵器瘫痪。随后赶到的小队成员将敌人一一擒获。经此事件，年轻学员更加谨慎对待每一个潜在危险，他知道未来的路还很长，而他必须始终站在守护学院与宇宙安全的前沿。
年轻学员带着小队成员凯旋而归后，立刻投入到对那种奇特基因序列的研究当中。经过数周努力，终于发现这是一种远古时期用来封印强大基因力量的锁序。
与此同时，学院收到消息，在遥远星系有一处神秘遗迹开启，疑似与这种基因锁序有关。年轻学员决定带队前去探寻。到达遗迹后，他们遭遇了层层陷阱与防御机制。
就在众人艰难前行时，年轻学员敏锐察觉到一股熟悉的恶意气息。原来是之前的敌人不知用何种方法提前来到此处，并且设下圈套。
年轻学员冷静指挥，让队员们相互配合，逐一破除陷阱。他独自面对敌人，利用刚研究透的基因锁序原理，暂时封印住了敌人的基因力量，轻松将其制服。