刘璋的归降让刘琮松了一口气，对于刘璋，刘琮第一想的便是妥善安置，首先刘琮让刘璋将自己的财物自己保管，随后对成都的文武坦言：“若愿意继续跟随侍奉刘璋的，便随刘璋一同前往荆州公安。”
刘琮为了益州的安定，只能是将刘璋调离益州，公安这边，是刘琮的练兵之所在，戒备森严，刘琮不担心会有乱子，而刘琮再加赠了振威将军印信给刘璋，但这只是一个虚衔，但这也就是意味着刘琮是要给刘璋俸禄的，并在公安划拨了一块地方赠予刘璋，以作财资，刘琮曾询问刘璋是否要做文官之类的事情，不要不动兵权，刘琮是愿意给他极大的自由。
但刘璋为了避嫌，以免惹祸上身，推辞掉了，至于他的儿子刘循，也随刘璋一起前去，送走了刘璋之后，刘琮这才开始对自己这边的进行梳理。
毕竟这一次入蜀大获全胜，是要对下面的部曲进行加官进爵了。
当然，老套路了，文武官职，乃至于爵位都是将表奏烧给天子，这种模式刘琮总觉得有一种大汉天子已经驾鹤归西的感觉。
刘琮先要将自己的文武官职提一提，才能犒赏下面的官员，文职自领益州牧，荆州牧，他的武职本来是镇南将军二品，属于四镇将军序列，而按照顺序由大到小是四征，四镇，四安，四平，刘琮若是进一步则应该是征南将军，或者更上一层就是前后左右将军，再上面就是大将军、骠骑将军、车骑将军、卫将军。
这些官职，都是可以加封一个大字的，形容资历，比如征西大将军，镇南大将军，平西大将军，骠骑大将军等，刘琮在武职上面倒是犯了难，自己资历不深，不好加封大字，进为四征将军意义不大。
而大将军，骠骑将军又显得有些好高骛远，便是选择前后左右将军四方序列，最后磋商之下，为右将军比较妥当。
首先庞统是这一次平定蜀地的统筹之人，同诸葛亮一般，为益州都督，统筹大小战事全局。
益州别驾张松功不可没，赏赐金银珠宝无算，仍然为别驾，治理政事，张松这个官职不能再高了，刘琮便是赐了张松一个汉嘉亭侯的爵位，法正为益州中军师，中军师这个职位是曹操最开始设立的，是荀攸的职位，类似于身边的谋主级别，比军师中郎将要高一些，法正的才能刘琮是信得过的。
徐庶为荆州中军师，不日回襄阳述职，这也算是将徐庶提了一层了。
除此之外，益州的文臣，经过筛选，没有能力的还要下放下去，文臣这边刘琮可以大刀阔斧的进行改进，毕竟他们没有什么兵权，该剔除的剔除，不过这个数量极少变动，也是考虑到益州这边局势。
剩下的慢慢一步一来。
武将方面，提拔得就比较多了，大多数都是中郎将，荆州的武将不能忘了，那是跟随刘琮从最初就挣扎求生的将领心腹，文聘为安东将军仍领讨虏军，从刘磐为安南将军仍领江夏军，黄忠为安西将军仍领奉天军，表兄张允为安北将军仍领长水军，此四人为四安将军。
自己的表兄张允虽然没有什么大的功劳，但其实从最开始到现在他也是少有一直跟随刘琮的‘老人’了，没有功劳就是最大的功劳，且没有差错，虽然他的能力不如甘宁，但若是没有张允的水军支持，恐怕刘琮没有今天，若是其他人都封赏了，却唯独漏了自己的表兄，岂不是寒了他的心？
表兄虽然能力中庸，但也是水战娴熟，虽然大的战略眼光没有，但是荆州又诸葛亮，徐庶，只需要照本宣科即可。
除此之外，魏延提拔为镇军将军，霍峻为镇护将军，二人仍领奉天军，日后回荆州述职，甘宁为横海将军，王威为轻车都是从校尉，中郎将级别提拔上来了，属于三到四品杂号将军，但无论如何，将军也是将军比中郎将要高啊。
关羽为平东将军，仍领忠义军，坐镇益州；张飞为平南将军，仍领玄德军，坐镇益州；赵云为平西将军，仍领龙骧军；庞羲为平北将军，其部众新设一军为平北军。
庞羲的能力暂且不论，他这边是献出了巴西一郡之地，且将巴西郡的官吏任免，钱粮等等交给了刘琮，不论如何，其地位在刘璋时代本来等同于一方诸侯，对征蜀之战也意义重大，不如此，不足以安抚其心，吴懿就不一样了，虽然是率兵投诚，但本来就是部将。
除了上述诸人以外，沙摩柯进取有功，加为征蜀将军仍领无当飞军，回公安镇守武陵郡；吴懿为安众将军，陈到为安远将军，廖化为平虏将军，刘封为平寇将军，周仓为平难将军，关平虎牙将军，严颜为建武将军，此皆是杂号将军，皆在三品，四品。
其余新降的文武，诸如孟达等人也有提拔。
安排完了众人的事情之后，自然是大摆庆功宴席，好生庆功一番。
益州的事务大抵上是正常运转，而刘琮这边还在统筹兵马，准备讨伐张鲁事宜，因为沙摩柯这边的五溪蛮，也就是无当飞军，是不能调离日久，刘琮便是先行让其回返。
最后折算上来，关羽忠义军，张飞玄德军，赵云龙骧军原来的部曲为主，加上汉中和白水降军，死伤之后，总共有三万人，大体还在，而庞羲这边的平北军最多，有三万人，刘琮严令庞羲裁汰下老弱，整整少了一万，只余了两万人，刘琮让庞羲率兵到葭萌关驻兵，用新式练兵法练兵，以提升这两万人的战斗力，并未讨伐张鲁做准备。
除此之外，自己的奉天军经过涪城一战，身边只有一千多人，幸好魏延还在这边，合起来，奉天军也能凑个五千。
而成都这边投降的兵马也有三万，裁撤下来不合格的更多，只有一万五千人，各路裁汰下来的两三万人便是分散给个重要城镇做守备兵，刘琮将吴懿的一万军并给关羽，成都的一万五千甲士对半分给张飞赵云，并分给他们两员将领，严颜并入张飞这边，孟达并入赵云这边。